Για την περίοδο 2013-2015 το Παρατηρητήριο για την Κρίση χρηματοδοτήθηκε από χορηγία του Ιδρύματος Σταύρος «Νιάρχος». Το Παρατηρητήριο συμμετείχε σε ερευνητικά προγράμματα που χρηματοδοτούνταν από ελληνικούς, ευρωπαϊκούς και διεθνείς φορείς.